葡萄是重要经济作物与大众消费水果。近期,我国科学家成功绘制出涵盖葡萄属三大地理种群的单倍型超级泛基因组图谱。相关成果来自潍坊现代农业山东省实验室(北京大学现代农业研究院)叶文秀研究员和郭立研究员团队,日前被国际科技期刊《自然·遗传学》在线发表。
据介绍,葡萄属于葡萄科葡萄属植物,分为麝香葡萄亚属和真葡萄亚属,目前已发现70余个种;根据葡萄的地理分布,可分为欧亚种群、北美种群和东亚种群。鉴于葡萄基因组因频繁杂交而具有高度杂合性,单倍型基因组能精确解析杂合区域序列,有助于分析葡萄育种历史。
“基于仔细遴选的72个葡萄种质材料,我们构建起葡萄单倍型系统发育进化树。”叶文秀说,研究显示,欧亚种群和北美种群存在较多杂交事件,而东亚种群较少,表明东亚种群未被充分利用。在漫长的持续驯化和育种改良中,现代葡萄品种的遗传多样性缩小、抗性丢失,使其易受病虫害、逆境等各种不利条件的影响。因此,未被利用的葡萄属植物具有显著的育种潜力。
在进一步研究中,科研人员还基于葡萄属超级泛基因组、群体转录组学和表型组学等多组学数据,挖掘到葡萄霜霉病抗性相关遗传变异和抗病基因。团队还证实,在高质量泛基因组辅助下,多组学关联分析能够高效开发作物重要农艺性状的分子标记、挖掘功能基因。叶文秀说,这些研究成果为培育更美味、更抗病的葡萄品种提供了理论基础。
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